Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms