Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf3Q07104 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms