Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx2-3P97334 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms