Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx2P81066 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx2P81066 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx2P81066 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx2P81066 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx2P81066 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx2P81066 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx2P81066 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx2P81066 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx2P81066 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms