Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Copz1P61924 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copz1P61924 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms