Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm1P58771 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm1P58771 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm1P58771 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms