Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strn4P58404 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Strn4P58404 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Strn4P58404 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Strn4P58404 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn4P58404 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Strn4P58404 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Strn4P58404 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn4P58404 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Strn4P58404 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms