Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms