Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf9P54130 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgf9P54130 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms