Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna7P49582 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms