Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpreP49446 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpreP49446 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpreP49446 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpreP49446 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpreP49446 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpreP49446 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpreP49446 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpreP49446 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpreP49446 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpreP49446 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpreP49446 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpreP49446 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms