Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc2P43407 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms