Protein–RNA interactions for Protein: P43267

Sox15, Protein SOX-15, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox15P43267 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox15P43267 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox15P43267 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms