Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mmp12P34960 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mmp12P34960 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms