Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms