Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa5P28312 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa5P28312 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa5P28312 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa5P28312 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa5P28312 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa5P28312 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa5P28312 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa5P28312 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa5P28312 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa5P28312 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa5P28312 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa5P28312 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa5P28312 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa5P28312 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa5P28312 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa5P28312 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa5P28312 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa5P28312 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa5P28312 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa5P28312 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa5P28312 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa5P28312 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa5P28312 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa5P28312 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa5P28312 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa5P28312 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa5P28312 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa5P28312 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa5P28312 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa5P28312 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa5P28312 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa5P28312 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa5P28312 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa5P28312 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa5P28312 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms