Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
XRCC5P13010 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC5P13010 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XRCC5P13010 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms