Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06334 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06334 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06334 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P06334 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06334 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06334 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06334 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06334 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06334 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06334 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06334 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06334 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06334 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06334 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06334 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06334 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06334 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06334 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06334 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06334 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06334 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06334 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06334 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06334 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06334 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06334 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06334 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06334 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06334 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06334 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06334 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06334 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06334 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06334 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06334 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06334 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06334 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06334 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06334 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06334 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06334 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06334 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06334 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06334 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06334 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06334 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06334 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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