Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IkbkbO88351 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IkbkbO88351 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IkbkbO88351 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IkbkbO88351 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IkbkbO88351 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IkbkbO88351 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IkbkbO88351 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IkbkbO88351 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IkbkbO88351 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IkbkbO88351 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms