Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms