Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms