Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjd2O54851 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd2O54851 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms