Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp15O54732 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mmp15O54732 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mmp15O54732 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mmp15O54732 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Mmp15O54732 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp15O54732 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp15O54732 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp15O54732 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp15O54732 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp15O54732 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp15O54732 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp15O54732 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp15O54732 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp15O54732 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp15O54732 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp15O54732 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp15O54732 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp15O54732 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp15O54732 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp15O54732 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp15O54732 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp15O54732 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp15O54732 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp15O54732 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp15O54732 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp15O54732 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp15O54732 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp15O54732 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mmp15O54732 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp15O54732 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp15O54732 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp15O54732 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp15O54732 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp15O54732 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp15O54732 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp15O54732 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp15O54732 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp15O54732 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp15O54732 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp15O54732 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp15O54732 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp15O54732 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp15O54732 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp15O54732 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp15O54732 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp15O54732 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mmp15O54732 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp15O54732 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp15O54732 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp15O54732 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp15O54732 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp15O54732 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp15O54732 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms