Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kpna6O35345 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kpna6O35345 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kpna6O35345 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms