Protein–RNA interactions for Protein: L7N476

Gm9611, Predicted gene 9611 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9611L7N476 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9611L7N476 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9611L7N476 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms