Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms