Protein–RNA interactions for Protein: F6QL70

Gm17669, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17669F6QL70 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm17669F6QL70 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm17669F6QL70 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm17669F6QL70 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm17669F6QL70 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm17669F6QL70 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm17669F6QL70 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17669F6QL70 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm17669F6QL70 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm17669F6QL70 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm17669F6QL70 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm17669F6QL70 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17669F6QL70 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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