Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms