Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms