Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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