Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctnna3Q65CL1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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