Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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