Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms