Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms