Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm13861-201ENSMUST00000137136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm29617-201ENSMUST00000185730 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Atp5h-208ENSMUST00000180072 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm33024-201ENSMUST00000203143 633 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm10250-201ENSMUST00000090488 482 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 H2afb2-201ENSMUST00000118616 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm13551-201ENSMUST00000121286 430 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 1700013G24Rik-201ENSMUST00000048893 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc18Q640L5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms