Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TtrP07309 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TtrP07309 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms