Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms