Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms