Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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CartptP56388 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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CartptP56388 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CartptP56388 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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CartptP56388 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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CartptP56388 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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CartptP56388 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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CartptP56388 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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