Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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