Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Washc5-202ENSMUST00000227725 2618 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Mill2-206ENSMUST00000228493 2043 ntAPPRIS P4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ctnna3-201ENSMUST00000075099 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Stam2-201ENSMUST00000102759 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cpsf3-201ENSMUST00000067284 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms