Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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