Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ggta1P23336 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ggta1P23336 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ggta1P23336 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ggta1P23336 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ggta1P23336 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ggta1P23336 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ggta1P23336 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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