Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nccrp1G3X9C2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nccrp1G3X9C2 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nccrp1G3X9C2 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nccrp1G3X9C2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nccrp1G3X9C2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nccrp1G3X9C2 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nccrp1G3X9C2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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