Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms