Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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CartptP56388 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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CartptP56388 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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CartptP56388 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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CartptP56388 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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CartptP56388 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms