Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12269-201ENSMUST00000122273 717 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VdrP48281 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms