Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Tgfb1P04202 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Tgfb1P04202 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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