Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1a4Q9WV27 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms