Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IncenpQ9WU62 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IncenpQ9WU62 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IncenpQ9WU62 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IncenpQ9WU62 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms